Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCZQ96LD1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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