Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPK3Q96L96 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms