Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms