Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms