Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTV1Q96GA3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms