Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYTL4Q96C24 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms