Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF3Q92576 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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