Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms