Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTTNBP2Q8WZ74 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms