Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER1Q8TC90 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms