Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms