Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VWA5B2Q8N398 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA5B2Q8N398 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms