Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms