Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms