Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms