Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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