Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms