Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP188Q5SRE5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms