Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms