Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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