Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms