Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms