Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A12Q504Y0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms