Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms