Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC27Q2M243 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms