Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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