Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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