Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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PUM3Q15397 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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