Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms