Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IHHQ14623 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IHHQ14623 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
IHHQ14623 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IHHQ14623 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IHHQ14623 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms