Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms