Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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