Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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