Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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