Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1orf61Q13536 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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