Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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TRAF1Q13077 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF1Q13077 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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