Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC10A2Q12908 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms