Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP1B1Q10567 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms