Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms