Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTBQ06643 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBQ06643 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms