Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms