Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms