Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNB1P98172 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNB1P98172 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms