Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIM1P81133 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms