Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBG1P69891 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HBG1P69891 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBG1P69891 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HBG1P69891 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms