Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1A1P68104 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms