Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKP1P63208 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms