Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms