Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UFM1P61960 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms