Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms